原原种应在原原种繁殖区内繁殖，由育种者或品种所有者指导进行。原种在原种繁殖区繁殖，繁殖原种用的种藕应来自于原原种。原种纯度应达97%以上。生产用种宜在生产用种繁育基地内繁殖，繁殖生产用种的种藕应来自于原种或直接来自原原种。生产用种纯度应达95%以上。

品种间宜采用水泥砖墙（深1.0m～1.2m，厚25㎝）或空间（10m以上）隔离。原原种繁殖小区面积宜67m²～667m²，原种与生产用种繁殖小区面积宜667m²～1500m²。同一田块连续几年用于繁种时，应繁殖同一品种，更换品种时应先种植其它种类作物1年～2年。

对于连作种藕田，宜推迟10～15天定植，定植前挖除上年残留植株。生长期应将花色、花形、叶形、叶色等性状与所繁品种有异的植株挖除。进入花期后，宜10～15天巡查一遍，去杂并及时摘除花蕾和莲蓬。进入枯荷期后，对于田块内仍保持绿色的个别植株应予以挖除。种藕采挖时，应对皮色、芽色、藕头与藕条形状等与所繁品种有异的藕支及感病藕支予以剔除。种藕贮运时，同一品种应单独贮藏、包装和运输，并做好标记，注明品种名称、繁殖地、供种者、采挖日期、数量及种藕级别等。